认证机构的合法性
在中国，只有被国家认监委(CNCA)批准的认证机构才能开展管理体系认证业务，才是合法认证机构，但即使具有资质，还得注意其资质是否为有效状态，同时还得具体看其被批准的认证类别及认证领域的范围，就像营业执照一样，会规定有哪些认证可以做。这些信息都可以在国家认监委（CNCA）网站上公开查询到，同时还要关注认证机构是否有违法/被处罚信息，或自身经营状况如何（可查工商信息），否则还是会出现问题。
认证机构的品牌、技术实力、能力
拥有强影响力的认证机构，往往其人员（审核员）配备齐全、技术实力/能力强大，服务网络完善（不是在各地简单设个办公室），这对企业来讲非常有利。
选择有一定实力的品牌认证机构，其认证证书公信力强，可带来正面的宣传效果，同时可降低企业进行认证所带来的风险与损失，这也是大企业选择的品牌认证机构的原因。现在一些重点项目招标已经要求必须是认证机构出具的认证证书才被认可，所以选择品牌认证机构进行认证的作用不言而喻。
认证费用
要相信一分钱一分货，选择认证机构，不能谁价格低就选谁，低价格的认证会严重影响认证的有效性和公信力，国家相关部门对管理体系认证规定有基础价格，就像市场上的其他商品一样，品牌、信誉、质量、服务才是*重要的。
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